R&D 세액공제 대상 비용 총정리｜인건비·외주비·재료비 인정 기준

R&D 세액공제 대상 비용 총정리｜인건비·외주비·재료비 인정 기준

R&D 세액공제에서 가장 많이 부인되는 이유는 기술의 문제가 아니라 ‘비용 분류’입니다. 🔎

2026년 이후 R&D 세액공제는 공제율보다도 대상 비용을 어떻게 나누고 증빙하느냐가 공제 성패를 좌우합니다.

 

이 글에서는 2026년 기준으로 R&D 세액공제에서 가장 핵심이 되는

인건비·외주비·재료비의 인정 기준을 실무 관점에서 정리합니다. 📘

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📌 R&D 세액공제 ‘대상 비용’의 기본 원칙

R&D 세액공제에서 비용 인정의 출발점은 하나입니다.

“해당 비용이 연구·개발 활동에 직접 사용됐는가?”

 

다음 세 가지 요건이 동시에 충족돼야 합니다.

 

✔ 연구 목적의 지출일 것

✔ 연구 인력 또는 연구 과정과 직접 연결될 것
✔ 객관적인 증빙이 존재할 것

 

이 중 하나라도 부족하면 비용은 R&D에서 제외될 가능성이 높아집니다. ⚠️

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👤 R&D 인건비 인정 기준

R&D 비용 중 가장 비중이 크고 동시에 분쟁이 가장 잦은 항목이 인건비입니다.

인정되는 인건비의 핵심 기준은 다음과 같습니다.

 

✔ 실제 연구 업무 수행 여부
✔ 연구 참여 비율의 합리성
✔ 급여·상여·4대 보험 등 급여성 비용 여부

 

연구원이 전담 연구를 하지 않는 경우, 업무 비율에 따라 인건비를 안분해야 하며, 이 비율을 입증할 자료가 필요합니다. 🧾

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⚠️ 인건비에서 자주 부인되는 사례

다음과 같은 경우 인건비는 R&D 비용으로 부인될 가능성이 큽니다.

 

✔ 대표자 급여를 전액 R&D로 처리
✔ 연구 기록 없이 형식적으로 배분
✔ 일반 관리·영업 인력을 연구 인력으로 포함

 

2026년 이후에는 ‘연구에 참여했다’는 주장보다 ‘참여를 증명할 자료’가 훨씬 중요해졌습니다.

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🏭 재료비·소모품비 인정 기준

재료비와 소모품비는 연구 과정에서 사용된 경우에만 인정됩니다.

 

핵심 판단 기준은 다음과 같습니다.

 

✔ 연구 실험·시제품 제작에 사용됐는가
✔ 일반 생산·판매 목적과 구분되는가
✔ 사용 내역이 기록으로 남아 있는가

 

시제품 제작 과정에서 발생한 재료비는 요건을 충족하면 R&D 비용으로 인정될 수 있지만, 양산용 재료비는 제외됩니다. 🧪

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⚙️ 외주·위탁 연구비 인정 기준

외주·위탁 연구비는 2026년 이후 가장 주의가 필요한 항목입니다.

 

다음 요건을 충족해야 합니다.

 

✔ 연구 목적이 계약서에 명확히 기재
✔ 결과물이 연구 성과로 귀속될 것
✔ 단순 용역·제작과 구분될 것

 

단순 개발 대행이나 결과물 납품 중심의 계약은 R&D 외주비로 인정받기 어렵습니다. ❗

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📄 외주비에서 자주 발생하는 리스크

외주비 관련 부인 사례는 다음과 같습니다.

 

✔ 계약서에 연구 목적 명시 없음
✔ 결과물 귀속 조항 부재
✔ 내부 연구 기록과 외주 내용 불일치

 

외주 연구는 ‘연구의 일부를 맡긴 것’이라는 구조가 문서로 명확히 남아 있어야 합니다.

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🧾 기타 비용(시험·분석·감가상각)

다음 비용도 요건을 충족하면 R&D 세액공제 대상이 될 수 있습니다.

 

✔ 시험·분석 비용
✔ 연구 장비 감가상각비
✔ 연구용 소프트웨어 사용료

 

다만 이 비용들은 연구 전용 사용 여부가 핵심 쟁점이 되며, 공용 자산일 경우 안분 기준이 필요합니다. 📊

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⚠️ 2026년 이후 비용 인정에서 달라진 점

2026년 이후에는 형식적인 분류보다 실제 연구 흐름과의 연결성이 더 중요해졌습니다.

 

✔ 연구 기록의 연속성
✔ 비용 발생 시점과 연구 단계의 일치
✔ 연구 성과와 비용의 논리적 연결

 

이 세 가지가 맞지 않으면 공제 금액이 감액되거나 사후 추징으로 이어질 수 있습니다. 🚨

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📘 정리

R&D 세액공제의 핵심은 얼마를 썼느냐가 아니라 어떻게 분류하고 증빙했느냐입니다.

인건비·재료비·외주비는 모두 공제 대상이 될 수 있지만, 같은 비용이라도 처리 방식에 따라 결과는 완전히 달라집니다.

2026년 이후에는 비용 관리 수준이 곧 공제 가능성이라는 점을 반드시 기억해야 합니다. ✔️

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🔜 다음 글 예고

다음 글에서는 「2026 국가전략기술 세액공제 확대｜기존 R&D 공제와 차이점」을 다룹니다.

일반 R&D와 전략기술 공제의 결정적 차이를 정리합니다. 🧠

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📌 2026 R&D 세액공제 전체 흐름 한눈에 보기

이 글은 「2026 R&D 세액공제 실무 가이드」 시리즈 중 하나입니다.
R&D 세액공제의 구조·신청·신고·유지·리스크 관리까지
전체 흐름을 한 번에 보고 싶다면 아래 허브글을 확인하세요.

👉 2026 R&D 세액공제 실무 가이드 전체 보기